西藏自治区档案馆建于1959年6月，由西藏文物古迹、文件档案管理委员会文件档案组发展而来，是西藏最大的综合性档案馆，原馆址在拉萨市北京西路。
1988年建成新馆，馆址在拉萨市鲁定南路，占地面积3万平方米，建筑面积9000余平方米，其汉、藏文馆名分别由邓小平和阿沛·阿旺晋美题写。档案馆有职工70人，其中藏族占90%以上。档案馆存有历史档案136个全宗，300万卷(册、件)，收藏有自元代至20世纪50年代，约700多年的档案资料，内容涉及政治、经济、历史、宗教、天文、地理、科技、工艺及其文化艺术、风土习俗、天灾人祸、徭役赋税等。档案资料文字以藏文为主，还有汉、蒙古、满、回、梵、尼、英、俄等10余种文字，载体有木质、骨质、纸质、叶质、金石以及帛等，部分珍本典籍用金、银、翡翠、珍珠、珊瑚、朱砂等研磨调制后书写。
1990年7月，江泽民视察档案馆，题写了“藏民族优秀的历史文化是中华民族文化宝库中的重要组成部分”。档案馆编纂出版了《西藏历史档案荟萃》，与有关部门合作出版了一系列照片及图书资料。21世纪初，档案馆投入使用缩微系统设备和计算机网络设备。
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