建筑 占地面积1.7万平方米。主要建筑有主殿和热振拉章等。①主殿。坐北朝南，二层建筑结构。第一层为大经堂，专门为僧人念经进行各种佛事活动的场所，主要供奉妙集金刚神，大经堂四周有若干小经堂，内藏佛像与经卷。经堂为夹壁，内壁为经书架，有《甘珠尔》、《丹珠尔》等经书，外壁为石墙。第二层有若干间寝室专供达赖、摄政等巡游路过居住，也有拉康、仓库若干。②热振拉章。位于主殿西侧，共分三层，第一层主要为库房，第二层是扎萨强佐(司库)的居所，第三层是热振活佛的寝宫、经堂。
组织机构 热振寺不同于其他格鲁派寺庙，寺内未设扎仓和康村，寺内一切政教大权均掌握在热振活佛手中。热振寺初由仲敦巴的弟子师徒相承，18世纪七世达赖封其经师阿旺曲丹为热振寺呼图克图，成为第一世热振活佛，从此开始通过转世方法相承。热振寺活佛之下设堪布1人，主要代理热振活佛之职，掌管全寺政教事务，任期不定。堪布之下设吉米1人，掌握财政，任期3～4年。吉米下设格贵1人，主管全寺喇嘛之清规戒律，有权处置寺内喇嘛，任期1年。格贵下还有聂巴和恰玛，掌管寺内钱粮物品和放茶施粥等。热振拉章又分为热振拉章和拉萨拉章，设管家1人，代理热振活佛之职，管理2座拉章内的一切事务。热振活佛任摄政期间，常住拉萨拉章内，拉萨拉章各级官员均为四品。热振寺刚建寺时只有五六十人，后来发展到500僧人，所属庄园33座、属寺7座，分别是曲桑寺、甘岗寺、江龙曲定寺、党丹寺、桑林寺、孜聂寺、关衮寺。另有3个牧场，分别是当雄的乌玛牧场、那龙香牧场、果聂牧场。
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